银河共和国的克隆人军队正在与分离主义联盟的机器人军队交战。尤达大师派极地学徒亚苏卡坦诺作为阿纳金的学徒参加克里斯托菲斯之战。杜库伯爵设计并绑架了塔图因·贾巴的小儿子。战斗结束后，绝地长老会派阿纳金、亚苏卡和机器人R2率领克隆人军队解救人质，而欧比-万肯诺比则前往塔图因·贾巴商讨结盟事宜。阿纳金和他的团队在泰西的一座寺庙里遇到了分离主义联盟的机器人军队和西斯战士阿萨基·文崔斯。虽然他们救出了贾巴的小儿子，但他们没有想到一个更大的阴谋正在等着他们。这部电影是华纳公司发行的唯一一部电脑动画《星球大战》电影，也是《星球大战》系列中唯一一部电影。